La fête préférée de Scooby-Doo et Sammy est là ! Avec ses faux monstres et ses bonbons à volonté, Halloween est le moment parfait pour les petits gourmands. Mais cette année, cette belle fête est gâchée lorsqu'un liquide toxique s'écoule dans le champ de citrouilles voisin. Cela crée des citrouilles volantes, ainsi qu'un énorme roi-citrouille, et le problème, c'est qu'ils veulent tout détruire. Il est du devoir de Scooby-Doo et ses amis de faire équipe avec Bill Nye The Science Guy et Elvira, maîtresse des ténèbres, afin de résoudre cet énorme mystère et sauver Crystal Cove !